Дата создания предприятия, как структурного подразделения Миннибаевского газоперерабатывающего завода, - 13.01.1976 года. В хозяйстве имелось 30 троллейбусов, которые работали на 2-х маршрутах протяженностью 31,5 км.
С 1 июля 1977 года троллейбусное хозяйство передано в ведение исполкома Альметьевского городского Совета депутатов трудящихся и министерства ЖКХ ТАССР.
В декабре 1982 года открылось движение троллейбусов по маршруту «Б.городок – АЗПЭН», протяженностью 7,2 км.
С 1 июля 1995 года преобразовано в коммунальное предприятие «Альметьевское троллейбусное управление». В 2000 году КП АТУ передано в ведомственное подчинение министерству транспорта и дорожного хозяйства РТ и переименовано в ГУП «Альметьевское троллейбусное управление».
В ноябре 2001 года введена в эксплуатацию новая троллейбусная линия, соединяющая «Больничный городок» с заводом «Радиоприбор» протяженностью 2,9 км.
В октябре 2002 года введена линия « Больничный городок – Торговый центр №2» протяженностью 3,9 км.
Постановлением администрации Альметьевского района и города Альметьевска от 31.10.2005 года №3479 ГУП «АТУ» преобразовано в муниципальное унитарное предприятие «Альметьевское троллейбусное управление».
С мая 2007 года начали перевозку пассажиров автобусами на городских маршрутах.
В настоящее время протяженность троллейбусных линий составляет 50,3 км, протяженность 6 маршрутов составляет 94,2 км. Парк подвижного состава составляют: 47 пассажирских троллейбусов, 10 автобусов ПАЗ-32054, 19 автобусов «HIGER», 2 автобуса ЛИАЗ – 525636 и 7 автомобилей «ГАЗЕЛЬ». Протяженность городских автобусных маршрутов составляет 100,4 км.
С 1 сентября 2008 года на баланс МУП «АТУ» передано 10 ед. школьных автобусов, обслуживающих 10 пригородных школьных маршрутов.